МИНЗДРАВСОЦРАЗВИТИЯ РОССИИ

Государственное бюджетное образовательное учреждение

высшего профессионального образования

ИРКУТСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ

(ГБОУ ВПО ИГМУ Минздравсоцразвития России)

Медико-профилактический факультет

Кафедра микробиологии

УТВЕРЖДАЮ

Проректор по УР ГБОУ ВПО ИГМУ Минздравсоцразвития России А.В.Щербатых _ 2011 г.

РАБОЧАЯ ПРОГРАММА УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЫ

КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ

для специальности: «лечебное дело»

Код по ОКСО: Разработчик:

Симонова Елена Васильевна, профессор кафедры микробиологии ГБОУ ВПО ИГМУ 2011г.

Рабочая программа составлена в соответствии с:

1. Государственным образовательным стандартом (ГОС) по соответствующим специальностям высшего профессионального медицинского и фармацевтического образования: Программа по МИКРОБИОЛОГИИ, ВИРУСОЛОГИИ, ИММУНОЛОГИИ (для студентов лечебных, медико-профилактических и педиатрических факультетов высших медицинских учебных заведений). – М.:

«ГОУ ВУНМЦ». 2000.- 65с.

2. Модели специалиста - квалификационной характеристики врачей по специальности «Лечебное дело».

3. Методическим пособием для преподавателей по составлению учебной программы.

– М.: ФГУ «ВУНМЦ Росздрава», 2000. – 36с.

4. Сборник положений Иркутского государственного медицинского университета. – РИО ГОУ ВПО ИГМУ РОСЗДРАВА, 2009. – 50с.

Рецензенты1:

1. Заведующий отделением гастроэнтерологии ООД, ассистент кафедры онкологии ГБОУ ВПО ИГМУ, к.м.н. Зубков Р.А.

2. Профессор кафедры инфекционных болезней ГБОУ ВПО ИГМУ, д.м.н. Аитов К.А.

УТВЕРЖДЕНА

на заседании кафедры полное наименование кафедры _ 20_ г. протокол № Зав. кафедрой микробиологии ГБОУ ВПО ИГМУ академик РАМН, профессор _В.И Злобин

СОГЛАСОВАНА

Председатель ФМС декан медико-профилактического факультета, доцент _А.И. Белых _ 20_ г.

Начальник учебного отдела …………… _ Е.Л. Воронова _ 20_ г.

ОГЛАВЛЕНИЕ

1. Обозначения и сокращения 2. Пояснительная записка 4- 3. Структуры и содержание дисциплины 6- 4. Рекомендуемая литература 5. Информационное обеспечение 5. Лист согласования Рабочей программы с другими дисциплинами специальности 6. Дополнения и изменения в Рабочей программе

ОБОЗНАЧЕНИЯ И СОКРАЩЕНИЯ

УИРС – учебно-исследовательская работа студента ИГМУ – Иркутский государственный медицинский университет

2. ПОЯСНИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА

2.1. ПРЕДМЕТ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЫ: «Клиническая микробиология»

входит в цикл элективных дисциплин до дипломной подготовки врача по специальности «лечебное дело» и занимает достойное место в системе обучения студентов в медицинских вузов.

Являясь фундаментальной научной дисциплиной, «клиническая микробиология»

позволяет понять сущность проблем, связанных с развитием оппортунистических инфекций эндогенного характера, а также госпитальных инфекций экзогенного происхождения, она относится к числу наук, знания которых необходимы каждому врачуклиницисту независимо от его профиля. А поскольку курс медицинской микробиологии проходит на младших курсах, когда еще не накоплены знания специальных дисциплин, то возникает сложность восприятия тех знаний клинической микробиологии, которые необходимы врачу-клиницисту в повседневной работе, то компенсировать это можно через проведение элективного курса для студентов лечебного факультета в 10 семестре.

Основное внимание в организации и проведении учебного процесса ориентировано на конечную цель подготовки врача общей практики в соответствии с квалификационными требованиями. При этом программа составлена таким образом, что ее могут выполнять преподаватели кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии. Однако, в зависимости от конкретных условий возможно комплексирование с любой кафедрой, имеющей интересы в области клинической микробиологии.

2.2. Программа данного элективного курса ставит своей целью дать единую методологическую основу для понимания основных вопросов клинической микробиологии, как базовой дисциплины, позволяющей выпускнику медицинского вуза формировать целостное представление о механизмах развития инфекционного процесса, вызванного микробами-оппортунистами и принципах диагностики и умению интерпретировать результаты микробиологических исследований.

2.3. В связи с этим в задачи изучения предмета «клиническая микробиология»

входит:

- понимание сущности развития оппортунистической инфекции и ее отличие от госпитальной инфекции экзогенного происхождения - знания диагностической ценности отдельных микробиологических методов при диагностике оппортунистической инфекции в зависимости от свойств возбудителя;

- знания забора и транспортировки клинического материала для микробиологических исследований;

- формирование у будущих врачей умения интерпретировать результаты микробиологических исследований.

2.4. Требования к уровню освоения содержания дисциплины В процессе освоения учебного материала по дисциплине студент должен получить представления:

- об особенностях биологических свойств индигенной микрофлоры человека - о функциональных свойствах индигенной микрофлоры человека - о роли индигенной микрофлоры человека в развитии оппортунистической инфекции.

- об экологической системе «макрорганизм-микрофлора» и влияния на нее факторов внешней среды на характер взаимоотношений микроорганизмов с организмом человека - о механизмах изменчивости в микробных популяциях и их практическое значение в клинических условиях;

студент должен знать:

- микробиологические методы лабораторной диагностики инфекционных заболеваний человека, используемые в клинической микробиологии для определения этиологии оппортунистической инфекции - особенности взятия и транспортировки исследуемого материала от больных;

- механизмы действия на микробную клетку антимикробных препаратов, осложнения при их применении, принципы рациональной терапии;

- формы иммунного ответа в ответ на действие микроба- оппортуниста - о санитарно-микробиологических исследованиях в лечебных учреждениях с целью определения эпидемического благополучия (объектов внешней среды стоматологических клиник: воздух, смывы с инструментария, рук персонала, определить стерильность шовного материала и лекарственных препаратов и др. по комплексу микробиологических показателей).

студент должен уметь:

- использовать диагностическую ценность отдельных методов - работать с патогенным биоматериалом и соблюдать правила безопасности работы с микроорганизмами III -IY группы патогенности;

- проводить взятие исследуемого материала от больного;

- проводить посев исследуемого материала на питательные среды с целью транспортировки в клиническую микробиологическую лабораторию.

Успешное выполнение программы дадут возможность студенту приобрести опыт (владеть) самостоятельно:

- расшифровывать антибиотикограмму;

- определять минимально-подавляющую концентрацию антибиотиков к культурам микроорганизмов;

- интерпретировать результаты микробиологических и иммунологических исследований в обследовании больных.

2.5. Место дисциплины в профессиональной подготовке выпускника Для эффективной организации учебного процесса разработана настоящая рабочая программа, которая ориентирована на модель специалиста соответствующая квалификационной характеристики врача – лечебное дело. В нее включены наиболее важные вопросы, знания которых необходимы для формирования общебиологического и клинического мышления обучающихся.

В процесс обучения включены микробов-оппортунистов, участвующих в развитии эндогенной инфекции, а также возбудителей госпитальной инфекции. Сделан акцент на изучение вопросов формирования механизмов защиты макроорганизма в процессе развития оппортунистической инфекции.

Преподавание «клиническая микробиология» проводится в виде семинарских занятий.

2.6. Объем дисциплины и вид учебной работы Занятия по «клиническая микробиология» проводится в Х семестре (5 курс). На ее выполнение отводится 12 часов, из которых учебные часы составляют 8 часов, самостоятельная работа студента – 4 часа. Форма обучения очная.

Виды контроля:

промежуточного итогового: зачет 3. «Структура и содержание дисциплины»

развитии оппортунистической инфекции Тема 1.2. Отличительные особенности микробов- 1,0 1, оппортунистов от классических патогенов в развитии инфекционного процесса развитии оппортунистической инфекции экологическую систему «макроорганизммикрофлора»

госпитальной инфекции экзогенного характера Тема 2.2. Дисбиоз как фактор риска развития 5 - - оппртунистической инфекции эндогенного характера.

Наименование дисциплины «КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ»

3.4.1.Содержание теоретических разделов дисциплины

«КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ»

РАЗДЕЛ I. Роль нормальной микрофлоры в развитии оппортунистической 1 Патогенность и вирулентность. Генетическая детерминация. Факультативные патогенны в структуре нормального микробиоценоза и их функциональная роль в микробиоценозе и поддержании гомеостаза человека.

2. Отличительные особенности микробов-оппортунистов от классических патогенов в развитии инфекционного процесса. Симбиоз микробных ассоциаций микроорганизмов и организма человека. Закономерности формирования биопленок. Роль факторов адгезии и колонизации в формировании биотопа в организме человека.

Метаболическая зависимость между микро- и макрорганизмом.

3.Особенность иммунного ответа при развитии оппортунистической инфекции Иммуногенная роль нормальной микрофлоры. Естественная иммунологическая толерантность.

4. Влияние факторов внешней среды на экологическую систему «макроорганизммикрофлора» Роль лекарственных препаратов в формировании агрессивных форм микробов в структуре микробиоценоза. Условия формирования госпитальных штаммов.

Рана как фактор риска развития госпитальной инфекции экзогенного характера. Характер взаимоотношений в микробиоценозе раны. Роль макроорганизма в развитии раневой экзогенной инфекции. Причины и следствия раневой инфекции.

Гетерогенность микробной популяции, циркулирующей в условиях лечебных учреждений. Этиология и критерии значимости.– Тактика антибактериальной профилактики и терапии при хирургических и ортопедических вмешательствах.

Дисбиоз как фактор риска развития оппортунистической инфекции эндогенного характера Причины формирования дисбиоза. Гетерогенность человеческой популяции с точки зрения восприимчивости к оппортунистической инфекции Нарушение колонизационной резистентности как фактор развития эндогенной инфекции. Роль нормальной микрофлоры в развитии эндогенной инфекции при инфаркте миокарда, язвенной болезни, перитонитах, эндокардитах, панкреатитах, эндокринных нарушениях и других соматических состояниях. Этиология и критерии значимости. Тактика антибактериальной профилактики и терапии Всего на самостоятельную работу 4,0 часа – 0,1 кредита п/п 1 Экология микроорганизмов:

Инфекция как разновидность паразитизма.

Экологические связи в микробиоценозах.

Иммунная система организма, ее особенности.

Биологический смысл иммунологической толерантности.

3 Микрофлора лечебных учреждений Гетерогенность микробных популяций, персистирующих в условиях Роль макроорганизма в развитии внутрибольничной инфекции.

Значение иммунного статуса человека в развитии вторичных форм Роль нормальной микрофлоры в развитии эндогенной инфекции Хеликобактериозная инфекция как форма эндогенной инфекции.

Роль нормальной микрофлоры в развитии катетерассоциированной Этиология постинтубационной пневмонии Внеаудиторная работа студента является одной из составляющих учебного процесса на кафедре и ей уделяется серьезное внимание со стороны преподавателей.

Самостоятельная работа студента при подготовке к занятию не только расширяет знания по предмету и способствует овладению методикой подбора и анализа литературы по теме.

3.4.4. «Контроль результатов изучения дисциплины»

1) Контроль подготовки студентов осуществляется по тестам составленным на основании «Типовых тестовых заданий для итоговой государственной аттестации выпускников высших медицинских учебных заведений по специальности – (М.: ВУНМЦ, 2003) (правила оценки тестового контроля: оценка «отлично» выставляется студентам ответившим на 80%, «хорошо» - 70-79%, «удовлетворительно» - 60-69%, «неудовлетворительно» < 60% вопросов). Примеры тестов – приложение № 3.

2) Контроль продуктивности усвоения материала предусматривает решение ситуационных задач и участие в семинарах.

«БАКТЕРИОЛОГИЯ»

1. Какие из перечисленных факторов, определяющих высокое качество анализов, непосредственно зависят от работы лаборатории?

а) время отбора проб б) методы отбора проб в) высококачественное лабораторное оборудование г) транспортировка д) высокий профессионализм сотрудников 2. Внутренний контроль качества работы бактериологической лаборатории включает в себя:

а) периодический мониторинг качества работы б) постоянный мониторинг качества работы в) контроль всех этапов анализа (от сбора образцов до выдачи ответа) г) периодический контроль методов изоляции патогенных объектов 3. Внешний контроль качества работы бактериологической лаборатории включает в себя:

а) периодический мониторинг качества работы б) постоянный мониторинг качества работы в) выборочный контроль соответствия полученных результатов при идентификации известных проверяющей стороне микроорганизмов 4. Контроль качества приготовленных питательных сред включает в себя:

а) определение прозрачности и цветности б) определение стерильности г) выращивание тест-микробов 5. Выделите стандартные тест-микробы, используемые как контрольные при определении антибиотикочувствительности:

а) Pseudomonas cepacia б) Pseudomonas aeruginosa в) Yersinia enterocolitica г) Staphylococcus aureus д) Streptococcus pyogenes 6. Определить ошибки при окраске мазка по Граму:

а) на фиксированный мазок на 1-2 мин. нанести р-р генцианвиолета б) промыть мазок дистиллированной водой в) нанести раствор Люголя на 1-2-мин.

г) обесцветить этиловым спиртом в течение 2-3 мин.

д) промыть водой е) докрасить водным раствором Фуксина в течение 1-2 мин.

ж) промыть водой,высушить

ОТВЕТЫ К ТЕСТОВОМУ КОНТРОЛЮ ПО СПЕЦИАЛЬНОСТИ

СИТУАЦИОННЫЕ ЗАДАЧИ.

Дать заключение по результатам комплексного обследования на пневмоцистоз у двух больных:

Лабораторная диагностика пневмоцистозной инфекции Ф.И.О._ Иванов ВикторВозраст 16 лет Дата поступления материала Определение Метод Диагностический титр Титр у обследуемого бронхиальных смывов (окраска по Романовскому) Лабораторная диагностика пневмоцистозной инфекции Ф.И.О._ Петров ВалентинВозраст 12 лет Дата поступления материала Определение Метод Диагностический титр Титр у обследуемого бронхиальных смывов (окраска по Романовскому) Больная Петрова И.С. 28 лет с подозрением на урогенитальный микоплазмоз обследуется с помощью серологических методов: РПГА для определения антител и агрегатгемагглютинации для определения антигена в крови.

Исследуются парные сыворотки от 15 апреля и 15 мая 1997г.

Дать заключение и установить диагноз на основании полученных данных. Оценить эффективность лечения.

Лабораторная диагностика микоплазмоза и уреаплазмоза Ф.И.О._Петрова И.С._ Возраст 28 лет Дата поступления материала _15 апреля 1997г._ Возбудитель Результат серологического исследования Лабораторная диагностика микоплазмоза и уреаплазмоза Ф.И.О._Петрова И.С._ Возраст 28 лет Дата поступления материала _15 мая 1997г._ Возбудитель Результат серологического исследования 4.1. Обязательная литература 1. Борисов Л.Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.:

МИА, 2002.-736с.: ил.

2. Поздеев О.К. Медицинская микробиология / Под ред акад. РАМН В.И.

Покровского. – М.: ГЭОТАР-МЕД, 2001.

7. Практикум по микробиологии: учеб. Пособие для студ. высш. учеб. Заведений / А.И. Нетрусов, М.А. Егорова, Л.М. Захарчук и др.; Под ред. А.И. Нетрусова – М.:

Издательский центр «Академия», 2005.- 608с.

4.2. Дополнительная литература 1. Воробьев А.А., Быков А.С. Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии: учебное пособие. – М.: МИА, 2003. – 236с.:ил.

2. Йоргенсен Дж. Х., Пфаллер М.А. Микробиологический справочник для клиницистов: Пер. с англ.- М.: Мир, 2006.- 243с.

3. Кулешова Л.И., Пустоветова Е.В., Рубашкина Л.А. Инфекционный контроль в лечебно-профилактических учреждениях. Серия «Медицина для вас». Ростов н/Д:

«Феникс», 2003 – 352с.

4. Лобзин Ю.В., Финогеев Ю.П., Крумгольц В.Ф., Семена А.В., Захаренко С.М., Винакмен Ю.А. Практика лабораторных исследований при инфекционных заболеваниях.

Под общей редакцией проф. Ю.В. Лобзина. Спб.: ЭЛБИ-СПб., 2005.- 276с.

5. Марри П.Р., Шей И.Р. Клиническая микробиология. Краткое руководство: Пер. с англ.-М.:Мир, 2006.-425с., ил. Р 6. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории: Методические указания МУ 4.2.2039-05.- Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2008.- 116с.

10. Частная медицинская микробиология с техникой микробиологических исследований: Учебное пособие/ Под ред. А.С. Лабинской, Л.П. Блинковой, А.С.

Ещиной.- М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2005.- 600с: ил.

1. www. рubmed.gov 2. iramn.ru 3. geotar.ru 4. antibiotic.ru 5. infectology.spb.ru/index.asp 6. consilium-medicum.com/media/infection/index.shml 7. microbiology.ru/cmac 10. immunologylinx.com

6. ПРОТОКОЛ СОГЛАСОВАНИЯ РАБОЧЕЙ ПРОГРАММЫ ДИСЦИПЛИНЫ

С ДРУГИМИ ДИСЦИПЛИНАМИ СПЕЦИАЛЬНОСТИ

иммунологии и аллергологии 7.Дополнения и изменения в рабочей программе учебной дисциплины В рабочую программу вносятся следующие изменения (дополнения):

Изменения (дополнения) в рабочей программе утверждены на заседании кафедры Зав. кафедрой академик, д.м.н., проф. Злобин В.И.